| Εθνικό Αλιευτικό Μητρώο |
| Εθνικό Μητρώο Αγροτικών Συνεταιρισμών και άλλων Συλλογικών Φορέων (ΕΜΑΣ) |
| Εθνικός Πίνακας Κριτών (Ν4310/14 άρθρο 30) |
| Ενιαίο Μητρώο Εμπόρων Αγροτικών Προϊόντων, Εφοδίων και Εισροών (Ε.Μ.Ε.Α.Π.Ε.Ε.) |
| Ηλεκτρονικό Περιβαλλοντικό Μητρώο |
| Κεντρικό Ηλεκτρονικό Μητρώο Οικοτεχνίας (ΚΗΜΟ) |
| ΜΗΤΡΩΟ ΕΠΙΧΕΙΡΗΣΕΩΝ ΠΟΥ ΔΙΑΘΕΤΟΥΝ ΑΔΕΙΑ ΚΑΤΑΠΟΛΕΜΗΣΗΣ ΕΝΤΟΜΩΝ ΚΑΙ ΤΡΩΚΤΙΚΩΝ |
| ΜΗΤΡΩΟ ΜΕΛΩΝ ΓΕΩΤ.Ε.Ε. |
| Μελισσοκομικό Μητρώο |
| Μητρώο Αγροτών και Αγροτικών Εκμεταλλεύσεων |
| Μητρώο Αδειών Εμπορίας & Παραγωγής Πολλαπλασιαστικού Υλικού |
| Μητρώο Βιοκαλλιεργητών |
| Μητρώο Βιοκτόνων Προιόντων |
| Μητρώο Βιομηχανιών Βιοτεχνιών Γεωργικών Φαρμάκων |
| Μητρώο Βιομηχανιών και Βιοτεχνιών Φυτοπροστατευτικών Προϊόντων |
| Μητρώο Γεωργικών Στατιστικών Οργάνων |
| Μητρώο Εγκαταστάσεων Βοοειδών – Χοίρων – Αιγοπροβάτων |
| Μητρώο Εγκαταστάσεων Γάλακτος & Γαλακτοκομικών Προϊόντων |
| Μητρώο Εγκαταστάσεων Προϊόντων Αυγών (Egg Products) |
| Μητρώο Εγκαταστάσεων Συσκευασίας Αυγών (Egg Packing Centres) |
| Μητρώο Εγκαταστάσεων Συσκευασίας νωπών οπορωκηπευτικών |
| Μητρώο Εγκαταστάσεων και Εμπόρων Ζωικών Προιόντων |
| Μητρώο Εγκεκριμένων Γεωργικών Φαρμάκων |
| Μητρώο Εγκεκριμένων Οχημάτων Μεταφοράς Ζωικών Υποπροιόντων |
| Μητρώο Εγκεκριμένων Σφαγείων |
| Μητρώο Εκπαιδευτών Προσωπικoύ Επιχειρήσεων Τροφίμων και Προσωπικό Ελεγκτικών Αρχών |
| Μητρώο Εμπόρων Ζώντων Ζώων |
| Μητρώο Εμπόρων Νωπών Οπωροκηπευτικών (ΜΕΝΟ) |
| Μητρώο Εξεταστικών Κέντρων Πιστοποίησης Γεωργικών φαρμάκων |
| Μητρώο Επαγγελματικών Αλιευτικών Σκαφών |
| Μητρώο Επιχειρήσεων Εμπορίας Λιπασμάτων |
| Μητρώο Επιχειρήσεων Ζωοτροφών |
| Μητρώο Ζωϊκού Κεφαλαίου (ΟΠΣ Κτηνιατρικής) |
| Μητρώο Ζώων Συντροφιάς |
| Μητρώο Θερμοκηπίων και Δικτυοκηπίων |
| Μητρώο Ιπποειδών |
| Μητρώο Καλλιεργητών Βιομηχανικής Κάνναβης |
| Μητρώο Καταστημάτων Πώλησης Γεωργικών φαρμάκων |
| Μητρώο Οινοποιών |
| Μητρώο Οργανισμών Ελέγχου και Πιστοποίησης |
| Μητρώο Πιστοποιημένων Αξιολογητών |
| Μητρώο Πιστοποιημένων Χρηστών Γεωργικών Φαρμάκων |
| Μητρώο Πλοίων / Εργοστασίων (Factory Vessels) |
| Μητρώο Πτηνοτρόφων και Πτηνοτροφικών εκμεταλλεύσεων ωοπαραγωγών ορνίθων |
| Μητρώο Συνταγογράφων Γεωργικών Φαρμάκων |
| Μητρώο Φυτοπροστατευτικών Προϊόντων |
| Μητρώο Ψεκαστικών Μηχανημάτων (Μητρώο Εξοπλισμού Εφαρμογής Γεωργικών Φαρμάκων -ΕΕΓΦ) |
| Μητρώο εγκαταστάσεων ανασυσκευασίας |
| Μητρώο εγκαταστάσεων εκχυλισμάτων κρέατος |
| Μητρώο εγκαταστάσεων επεξεργασίας βατραχοπόδαρων και σαλιγκαριών |
| Μητρώο εγκαταστάσεων επεξεργασίας λιπών |
| Μητρώο εγκαταστάσεων επεξεργασίας στομάχων, εντέρων & ουροδόχων κύστεων |
| Μητρώο εγκαταστάσεων μεταποιημένων αλιευτικών προϊόντων |
| Μητρώο εγκαταστάσεων παραγωγής προϊόντων με βάση το κρέας |
| Μητρώο εγκεκριμένων Μέσων Σήμανσης |
| Μητρώο εγκεκριμένων κέντρων αποθήκευσης & παραγωγής σπέρματος |
| Μητρώο εμπόρων ζωικών προϊόντων |
| Μητρώο εργαστηρίων επίσημου ελέγχου τροφίμων συνεργαζόμενων με τον ΕΦΕΤ |
| Μητρώο κέντρων Συλλογής Γάλακτος |
| Μητρώο κρεοπωλών Σχολής Επαγγελμάτων Κρέατος Αθηνών |
| Μητρώο μεταφορέων ζώντων ζώων |
| Μητρώο μεταφορέων και οχημάτων Ζωικών Υποπροϊόντων |
| Μητρώο παραγωγών και διαχειριστών Ζωικών Υποπροϊόντων |
| Πληροφοριακό σύστημα ενισχύσεων ευζωίας χοίρων Μ14.1 – ΠΑΑ 2014-2022 |
| Σύστημα Γεωγραφικών Πληροφοριών Ελαιοκομικού Τομέα και Αμπελουργικό Μητρώο (ΣΓΠ ΕΤ & ΑΜ) |
| Φυτοϋγειονομικό Μητρώο |
